O tehnică, dezvoltată în ultimul timp în domeniul micromanipulării gameților, este perforarea învelișului embrionului.
Embrionul este protejat de un înveliș proteic numit zona pellucida. Pentru a se putea implanta în uter, embrionul în dezvoltare trebuie să iasă din acest înveliș. În unele cazuri, embrionii cultivați in vitro pot avea o zona pellucida mai dură, de aceea procesul implantării poate fi defectuos şi eșuat.
Perforarea artificială sub microscop a zonei pellucida (assisted hatching) poate facilita implantarea embrionilor. Procedura este recomandată la femei relativ vârstnice (35 ani) și celor la care se observă la microscop că membrana pellucida este mai groasă, la embrionii obținuți prin crioconservare, pentru pacientele cu infertilitate de origine neclară și cazurile de eșec repetat al procedurii FIV. Operația se efectuează cu 1-3 ore înainte de embriotransfer.