În cazul hiperstimulării ovariene cu gonadotropine, există perspectiva de a se dezvolta şi de a se aspira un număr mare de ovocite, care vor asigura un număr mare de embrioni. Embrionii care nu sunt transferaţi în uter, pot fi congelaţi şi păstraţi.
Se congelează embrionii care au un scor bun din punct de vedere morfologic (numărul de celule, aspectul acestora, lipsa fragmentelor celulare) şi ale căror celule s-au divizat normal. Congelarea se face în aceeaşi zi cu embriotransferul. Embrionii se păstrează în azot lichid la temperatura de -196 grade Celsius.
Embrionii sunt decongelați şi transferaţi în uter atunci când prima încercare de embriotransfer a eşuat. Rata sarcinilor obținute după embrio-transferul unor embrioni congelaţi este totuși mai scăzută decât în cazul transferul embrionilor proaspeţi.